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    北京基因組所(國家生物信息中心)合作揭示腎癌和癌栓腫瘤微環境差異

      腎癌伴癌栓生長是腎癌惡性特征之一。約10%-30%晚期腎癌患者合并腎靜脈或下腔靜脈癌栓。未經治療的腎癌癌栓患者自然病程短,預后差。根治性腎切除及下腔靜脈癌栓取出術可有效改善預后,但手術難度大,圍手術期并發癥多。雖然目前術前新輔助治療可有效縮小腫瘤體積,降低手術難度及風險。但多項臨床研究發現腎癌和配對癌栓對同種治療方案差異較大。而基于bulk組學測序分析找到差異有限。因此亟需提高對腎癌和癌栓的深入認識,解析癌栓發生發展機制,為患者提供更加有效的新輔助治療方案。

      2022年3月31日,中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)慈維敏團隊和北京大學第三醫院泌尿外科馬潞林團隊合作,深入解析腫瘤組織和配對癌栓組織的腫瘤生態系統。該研究通過全景式地刻畫腎透明細胞癌原發腫瘤和癌栓的腫瘤微環境差異,為進展期腎癌治療和縮減癌栓提供潛在治療通路及靶點。此外,該研究還發現組織駐留型CD8+T細胞可作為潛在腎癌免疫治療標記物,進一步為腎癌和癌栓免疫治療提供理論依據。該研究以“Decoding the multicellular ecosystem of vena caval tumor thrombus in clear cell renal cell carcinoma by single-cell RNA sequencing”為題,發表在Genome Biology 雜志。

      該研究收集了腎透明細胞癌癌旁、原發腫瘤和癌栓組織來源的共120,000多個細胞。通過單細胞轉錄組測序分析,研究團隊發現組織駐留型CD8+T細胞在癌栓中顯著富集。通過整合CheckMate 025 PD-1免疫治療隊列,證實組織駐留型T細胞豐度和PD-1免疫治療敏感性相關。以上結果提示免疫治療對癌栓可能更加有效。此外研究團隊還發現癌栓組織中腫瘤細胞、巨噬細胞、內皮細胞、成纖維細胞內胞外基質重塑相關通路均顯著增強;通過細胞和細胞間互作分析,進一步明確了腫瘤-間質相互作用與透明腎細胞癌患者生存期降低顯著相關。以上研究結果為晚期腎癌縮減癌栓的新輔助治療提供潛在治療靶點,為靶向細胞外基質的治療提供了理論基礎。

      北京大學第三醫院泌尿外科主任醫師馬潞林教授、中國科學院北京基因組所(國家生物信息中心)慈維敏研究員、北京大學第三醫院泌尿外科主任醫師劉承教授為本文的共同通訊作者。慈維敏研究組副研究員史悅、在讀博士生張琪、北京大學第三醫院泌尿外科副主任醫師畢海和病理科醫師陸敏為本文的共同第一作者。該研究得到中科院戰略先導科技專項、國家重點研發計劃、國家自然科學基金等項目資助,以及中國科學院北京基因組所(國家生物信息中心)楊運桂研究員、趙永良研究員、北京大學白凡教授等眾多老師的指導與支持。

      論文鏈接

    單細胞水平解析腎透明細胞癌和癌栓腫瘤微環境差異

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